Genetic evaluation studies in Tabapuã cattle breed using random regression models-Review

Autores

  • Wéverton José Lima Fonseca Universidade Federal Rural de Pernambuco
  • Amauri Felipe Evangelista Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Federal do Paraná (UFPR), Curitiba-PR, Brasil.
  • Laylson da Silva Borges Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal, Universidade Federal do Piauí (UFPI), Teresina-PI, Brasil.
  • Gleissa Mayone Silva Vogado Universidade Federal do Piauí (UFPI), Bom Jesus-PI, Brasil.
  • Thales de Lima Silva Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia (UESB), Itapetinga-BA, Brasil.
  • Leandro de Oliveira Guerra Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Federal da Paraíba (UFPB), Areia-PB, Brasil.
  • João Marcos Monteiro Batista Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Federal da Paraíba (UFPB), Areia-PB, Brasil.
  • Kássio Alexandre Marques Programa de Pós-Graduação em Zootecnia, Universidade Federal da Paraíba (UFPB), Areia-PB, Brasil.
  • Severino Cavalcante de Sousa Júnior Universidade Federal do Piauí (UFPI), Parnaíba-PI, Brasil.

DOI:

https://doi.org/10.26605/medvet-v12n4-2460

Palavras-chave:

longitudinal data, heritability, animal model.

Resumo

The objective of this research is to estimate the genetic parameters and covariance components for growth characteristics in cattle from Tabapuã breed through random regression models (RRM). The estimates of covariance functions are considered nowadays, interesting alternatives to work with longitudinal data that allow the description of covariances changes due to time and prediction of variances and covariances along the growth curve. The RRM has been used to estimate the variance components and genetic parameters of milk production on the control day of the lactation curve and meat production in many species, including bodyweight of beef cattle and among these the cattle from Tabapuã breed, enabling us to work with features of growth curves that are measured repeatedly during the animal's life, known as longitudinal data. These models used in genetic evaluation in cattle are considered special cases of covariance functions that allow estimation of coefficients of genetic covariance functions directly through the method of restricted maximum likelihood.

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Referências

Albuquerque, L.G.; El Faro, L. Comparação entre os valores genéticos para características de crescimento de bovinos da raça Nelore preditos com modelos de dimensão finita e infinita. Revista Brasileira de Zootecnia, 37(2): 238246, 2008.

Albuquerque, L.G.; Meyer, K. Estimates of covariance functions for growth from birth to 630 days of age in Nelore cattle. Journal of Animal Science, 79(11): 2776-2789, 2001.

Albuquerque, L.G.; Meyer, K. Estimates of direct and maternal genetic effects for weights from birth to 600 days of age in Nelore cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics, 118(2): 83-92, 2001a.

Ali, T.E.; Schaeffer, L.R. Accounting for covariances among test day milk yields in dairy cows. Canadian Journal of Animal Science, 67(3): 637-644, 1987.

Bueno, R.S.; Torres, R.A; Ferraz, J.B.S.; Eler, J.P.; Mourão, G.B.; Mattos, E.C. Métodos de estimação de efeitos genéticos não-aditivos para características de peso e perímetro escrotal em bovinos de corte mestiços. Revista Brasileira de Zootecnia, 41(5): 1140-1145, 2012.

Cardoso, F.F.; Tempelman, R.J. Hierarchical Bayes multiplebreed inference with an application to genetic evaluation of a NeloreHereford population. Journal of Animal Science, 82(6): 1589-1601, 2004.

Carvalheira, J.G.V.; Blake, R.W.; Pollak, E.J.; Quaas, R.L.; Duran-Castro, C.V. Application of an autoregressive process to estimate genetic parameters and breeding values for daily milk yield in a tropical herd of Lucena cattle and in United States Holtein herds. Journal of Dairy Science, 81(10): 2738-2751, 1998.

Dias, L.T.; Albuquerque, L.G.; Tonhati, H.; Teixeira, R.A. Estimação de Parâmetros Genéticos para Peso em Diferentes Idades para Animais da Raça Tabapuã. Revista Brasileira de Zootecnia, 34(6): 1914-1919, 2005. Dias, L.T.; Albuquerque, L.G.D.; Tonhati, H.; Teixeira, R.D.A. Estimação de Estimação de parâmetros genéticos para peso do nascimento aos 550 dias de idade para animais da raça Tabapuã utilizando-se modelos de regressão aleatória. Revista Brasileira de Zootecnia, 35(5): 1915-1925, 2006.

Faria, C.U.D.; Magnabosco, C.D.U.; Reyes, A.D.L.; Lôbo, R.B.; Bezerra, L.A.F.; Sainz, R.D. Bayesian inference in a quantitative genetic study of growth traits in Nelore cattle (Bos indicus). Genetics and Molecular Biology, 30(3): 545-551, 2007.

Goddard, M.E.; Hayes, B.J. Genomic selection. Journal of Animal Breeding and Genetics, 124(6) 323-300, 2007.

Henderson, C. R. Analysis of covariance in the mixed model: higher-level, nonhomogeneous, and random regressions. Biometrics, 38(3): 623-640, 1982.

Jaffrézic, F.; Venot, E.; Laloë, D.; Vinet, A.; Renand, G. Use of structures antedependence models for the genetic analysis of gro curves. Journal Animal Science, 82(12): 3465-3473, 2004.

Kirkpatrick, M.; Heckman, A. Quantitative genetic model for growth, shape and other infinitedimensional characters. Journal of Mathematical Biology, 27(4): 429-450, 1989.

Kirkpatrick, M; Lofsvold, D; Bulmer, M. Analysis of the inheritance, selection and evolution of growth trajectories. Genetics, 124(4): 979-993, 1990. Lacerda, J.J.D.; Carneiro, P.L.S.; Martins Filho, R.; Malhado, C.H.M. Parâmetros e tendências genéticas para características de crescimento em bovinos da raça Nelore no Estado da Bahia utilizando inferência bayesiana. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, 15(1): 10-19, 2014.

Laird, N.M.; Ware, J.H. Random effects models for longitudinal data. Biometrics, 38(4): 963-974, 1982. Laureano, M.M.M.; Boligon, A.A.; Costa, R.B.; Forni, S.; Severo, J.L.P.; Albuquerque, L.G. Estimativas de herdabilidade e tendências genéticas para características de crescimento e reprodutivas em bovinos da raça Nelore. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, 63(1): 143-152, 2011.

Lopes, D.T.; Viu, M.A.D.O.; Magnabosco, C.D.U.; Faria, C.U.; Ferraz, H.T.; Trovo, J.B.D.F.; Pires, B.C. Estimativas de parâmetros genéticos de características andrológicas de touros jovens da raça Nelore por meio da inferência bayesiana. Revista Brasileira de Saúde Produção Animal, 12(1): 72-83, 2011.

Mercadante, M.E.Z.; Packer, I.U.; Razook, A.G.; Cyrillo, J.N.S.G.; Figueiredo, L.D. Dias ao Parto de Fêmeas Nelore de um Experimento de Seleção para Crescimento. II - Modelo de Regressão Aleatória. Revista Brasileira de Zootecnia, 31(4): 1726-1733, 2002.

Mercadante, M.E.Z.; Razook, A.G.; Trovo, J.D.F.; Cyrillo, J.N.S.G.; Figueiredo, L.D. Parâmetros genéticos do peso no início da estação de monta, considerando indicativo do peso adulto de matrizes Nelore. Revista Brasileira de Zootecnia, 33(5): 1135-1144, 2004.

Meyer, K. Estimating covariance functions for longitudinal data using a random regression model. Genetics Selection Evolution, 30(3): 221-240, 1998.

Meyer, K.; Hill, W.G. Estimation of genetic and phenotypic covariance functions for longitudinal ‘repeated’ records by restrict maximum likelihood. Livestock Production Science, 47(3): 185-200, 1997.

Morris, C.A.; Aymes, N.C. Heritability and repeatability of resistance to nematode parasites in comercial beef cattle. Proceedings of the New Zeland Society of Animal Production, (72): 236-239, 2012.

Neto, A.C.; Tholon, P.; Lui, J.F.; Lara, M.A.C.; Fonseca, C.; Ribeiro, M.N.; Sarmento, J.L.R. Modelos de regressão aleatória com diferentes estruturas de variância residual para descrever o tamanho da leitegada. Revista Ciência Agronômica, 42(4): 1043-1050, 2011.

Nobre, P.R.C.; Misztal, I.; Tsuruta, S.; Bertrand, J.K.; Silva, L.O.C.; Lopes, P.S. Analyses of growth curves of Nellore cattle by multiple-trait and random regression models. Journal of Animal Science, 81(4): 918-926, 2003. ]

Pala, A.; Savaş, T.; Uğur, F.; Daş, G. Growth curves of Turkish Saanem goats’ grouped for weight and body mass index. Archiv Tierzucht, 48(2): 185-193, 2005.

Pelicioni, L.C.; Albuquerque, L.G.; Queiroz, S.A. Estimação de componentes de co-variância para pesos corporais do nascimento aos 365 dias de idade de bovinos Guzerá empregando-se modelos de regressão aleatória. Revista Brasileira de Zootecnia, 38(1): 50-60, 2009.

Sakaguti, E.S.; Silva, M.A.; Quaas, R.L.; Martins, E.N.; Lopes, P.S.; Silva, L.O.C. Avaliação do crescimento de bovinos jovens da raça Tabapuã, por meio de análises de funções de covariâncias. Revista Brasileira de Zootecnia, 32(4): 864874, 2003.

Sarmento, J.L.R.; Torres, R.D.A.; Lobo, R.N.B.; Albuquerque, L.G.D.; Sousa, W.H.; Ernandes, J. Modelos de regressão aleatória na avaliação genética do crescimento de ovinos da raça Santa Inês. Revista Brasileira de Zootecnia, 39(8): 1723-1732, 2010.

Scalez, D.C.B.; Fragomeni, B.O.; Passafaro, T.L.; Pereira, I.G.; Toral, F.L.B. Polynomials to model the growth of young bulls in performance tests. Animal, 8(3): 370‑378, 2014.

Schaeffer, L.R. Strategy for applying genome-wide selection in dairy cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics, 123(4): 218-22, 2006.

Silva, M.A.; Thiébaut, J.T.L.; Valente, B.D. Modelos lineares aplicados ao melhoramento genético animal. Belo Horizonte: FEPMVZ Editora, Escola de Veterinária da UFMG, 2008. p. 375.

Sousa Júnior, S.C.; Boligon, A.A.; Santos, D.O.; Albuquerque, L.G.; Oliveira, S.M.P. Estimativas de Herdabilidades e Correlações Genéticas para Características de Crescimento da Raça Tabapuã Utilizando Modelo de Regressão Aleatória. Revista Científica de Produção Animal, 12(2): 154-157, 2010.

Sousa Júnior, S.C.; Diaz, I.D.P.S.; Santos, K.R.D.; Sousa, J.E.R.D.; Sarmento, J.L.R.; Martins, R. Genotype by environment interaction in different birth seasons for weight at 240, 365 and 450 days of age in Tabapuã cattle. Revista Brasileira de Zootecnia, 41(10): 2169-2175, 2012. Sousa Júnior, S.C.; El Faro, L.; Bignardi, A.B.; Cardoso, V.L.; Machado, P.F.; Albuquerque, L.G. Aplicação de modelos de regressão aleatória utilizando diferentes estruturas de dados. Ciência Rural, 44(11): 2058-2063, 2014.

Sousa Júnior, S.C.; Oliveira, S.M.P.; Albuquerque, L.G.; Boligon, A.A. Estimação de funções de covariância para características de crescimento da raça Tabapuã utilizando modelos de regressão aleatória. Revista Brasileira de Zootecnia, 39(5): 1037-1045, 2010.

Spiedel, S.E.; Enns, R.M.; Crews, D.H. Genetic analysis of longitudinal data in beef cattle: a review. Genetics and Molecular Research, 9(1): 19-33, 2010.

Talhari, F.M.; Alencar, M.D.; Mascioli, A.D.S.; Silva, A.D.; Barbosa, P.F. Correlações genéticas entre características produtivas de fêmeas em um rebanho da raça Canchim. Revista Brasileira de Zootecnia, 32(4): 880886, 2003.

Valente, B.D.; Silva, M.A.; Silva, L.O.C.; Bergmann, J.A.G.; Pereira, J.C.C.; Fridrich, A.B.; Corrêa, G.S.S. Estruturas de covariância de peso em função da idade de animais Nelore das regiões Sudeste e Centro-Oeste do Brasil. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, 60(2): 389-400, 2008.

Van Der Werf, J.; Schaeffer, L.R. Random regression in animal breeding. Ontario: University of Guelph. 1997, p70.

Williams, J.L.; Aguilar, I.; Rekaya, R.; Bertrand, J.K. Estimation of breed and heterosis effects for growth and carcass traits in cattle using published crossbreeding studies. Journal of Animal Science, 88(2): 460-466, 2010. Williams, J.L.; Garrick, D.J.; Speidel, S.E. Reducing bias in maintenance energy expected progeny difference by accounting for selection on weaning and yearling weights. Journal of Animal Science, 87(5): 1628-1637, 2009.

Wilmink, J.B.M. Adjustment of test-day milk, fat and protein yields for age, season and stage of lactation. Livestock Production Science, 16(4): 335-348, 1987.

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Publicado

03-04-2019

Como Citar

Fonseca, W. J. L., Evangelista, A. F., Borges, L. da S., Vogado, G. M. S., Silva, T. de L., Guerra, L. de O., Batista, J. M. M., Marques, K. A., & Sousa Júnior, S. C. de. (2019). Genetic evaluation studies in Tabapuã cattle breed using random regression models-Review. Medicina Veterinária, 12(4), 295–301. https://doi.org/10.26605/medvet-v12n4-2460

Edição

Seção

Produção Animal

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